Оптимальна довжина 3' некодуючої області для максимального полі(А) хвіст

-опосередкована стимуляція перекладу є приблизно 27 баз. Ці дані свідчать про те, що довжина 3'UTR відіграє важливу роль у визначенні обох ефективність перекладу

і стабільність мРНК.

3′-UTR містить сайти зв’язування як для регуляторних білків, так і для мікроРНК (міРНК). Зв’язуючись зі специфічними ділянками в межах 3′-UTR, мікроРНК можуть зменшувати експресію генів різних мРНК, або інгібуючи трансляцію, або безпосередньо викликаючи деградацію транскрипту.

У мРНК, 3′ нетрансльована область (3′UTR) розташована між стоп-кодоном кодуючої послідовності та полі(А) хвостом.

Поширеним підходом є отримати послідовність кДНК і використовувати програмне забезпечення для трансляції послідовностей (наприклад, ExPASy), щоб знайти найдовшу ORF. У більшості випадків послідовність між 5'-кінцем і початковим кодоном найдовшого ORF буде 5'UTR. Послідовність між стоп-кодоном і полі(А) буде 3'UTR.

3′ нетрансльована область (3′ UTR), послідовність після кодону термінації трансляції (стоп)., містить кілька регуляторних елементів, таких як сайти зв’язування мікроРНК і РНК-зв’язуючих білків, а також сайт сигналу поліаденілування та сайт додавання.

Середня довжина 3′-UTR в геномі людини становить близько 950 нуклеотидів у той час як для генів нейронів із високою експресією 3′ UTR досягає 1300 нуклеотидів (Sood та ін., 2006), однак ефективна ділянка зв’язування мікроРНК становить лише 7-8 нуклеотидів.